אמנפור אמרה בתוכנית "CNN News Central" כי "אלה היו שנתיים נוראיות עבורם, אבל כנראה שהם טופלו טוב יותר מהתושב העזתי הממוצע, משום שהם היו כלי מיקוח בידי חמאס". היא הוסיפה כי כעת, עם שחרורם של כל החטופים, חמאס "איבדה את כל מנופי הלחץ שלה - וזהו ניצחון לישראל".
בעקבות הסערה, פרסמה כאמור אמנפור התנצלות פומבית בתוכניתה ובחשבון הרשת החברתית X. היא אמרה כי דבריה היו "חסרי רגישות ושגויים", והוסיפה: "דיברתי על היום הזה כיום של שמחה אמיתית למשפחות הישראליות, שחוזות סוף־סוף ביקיריהן לאחר שנתיים של שבי נורא, וגם לתושבי עזה, שחוו הפוגה לאחר שנתיים של מלחמה קטלנית ואכזרית. אך אני מצטערת על דבריי – זו הייתה טעות".
אמנפור הדגישה כי שוחחה עם חטופים ששוחררו ועם בני משפחותיהם, וכולם סיפרו לה על תנאים מחרידים: "הם סיפרו על חיים במנהרות שבהן כמעט אי אפשר לנשום, על איסור לבכות, על רעב כבד ועל כך שנאלצו לחפור את קבריהם – וחלקם אף שבו היום בארונות קבורה".
זו אינה הפעם הראשונה שבה אמנפור מעוררת מחלוקת סביב סיקורה את ישראל. ב־2023, זמן קצר לאחר מתקפת ה־7 באוקטובר, אמרה בתוכניתה כי "רוב העולם מסכים עם דבריה של מלכת ירדן על קיומו של סטנדרט כפול כלפי ישראלים ופלסטינים". ב־2021 התנצלה אמנפור בפני הרב ליאו די לאחר שתיארה את רצח אשתו ושתי בנותיו בפיגוע ירי כ"עימות ירי", במקום רצח טרוריסטי. גם אז הודתה בטעותה.
בעבר השוותה אמנפור בין תקופת כהונתו של הנשיא טראמפ לבין ליל הבדולח, באמירה שעוררה זעם בירושלים. ממשלת ישראל דרשה מ־CNN להתנצל, והיא פרסמה הבהרה ובה כתבה כי "היטלר ופשעיו עומדים לבדם בהיסטוריה, ואני מצרה על כל כאב שגרמתי".