תחילה, הוגדרו במבצע 1099 יעדים שהוכרזו כמחוללי פשיעה, נגד 349 יעדים מודיעניים הוגשו כתבי אישום ונגד 33 מתוכם הואשמו ובוצעו מעצרים עד תום ההליכים. כמו כן, נתפסו 270 מיליון שקלים ו-381 רכבי יוקרה בשיתוף עם רשות המיסים. בנוסף, 595 אמצעי לחימה בהם רובים ואקדחים הוחרמו ו-18 הברחות סוכלו.
כאמור, מבצע "מסלול בטוח", פועל לטפל בפשיעה במגזר הערבי ופועל מחודש אוקטובר האחרון. מי שמוביל את המבצע מבחינה מערכתית היא המשטרה, בראשותו של המפכ"ל קובי שבתאי, שהטיל את האחריות על מי שמנהל אותו בפועל: ראש אח"מ ניצב יגאל בן שלום ומתחתיו קצינים בכירים בדרגות נצ"מ ומעלה.