בראש המשלחת הביטחונית יעמוד מנכ"ל משרד הביטחון אמיר אשל, והיא תכלול גם נציגים של גופי הביטחון של ישראל. בתחילה תוכנן שהמשלחת הביטחונית תהיה חלק מהמשלחת האזרחית, אולם פיצול המשלחות נובע מפנייה אמריקאית ומאיחוד האמירויות ולא מהכיוון הישראלי.
הבוקר דווח ב-YNET כי ראש הממשלה בנימין נתניהו הוא שהחליט להוריד את אנשי הביטחון מהטיסה לאמירויות, אולם ממשרד ראש הממשלה נמסר כי הדיווח הוא שקרי. "בתיאום בין המדינות, הוחלט שהמשלחת הישראלית לאיחוד האמירויות שתצא ביום ב', תדון בנושאים אזרחיים. נושאים נוספים, ביניהם גם נושאי ביטחון, ידונו בהמשך. הסוגיה תואמה בין ראש הממשלה לשר הביטחון", נמסר.
הנשיא הוציא צו שלפיו החרם על ישראל מבוטל וניתן לחתום על הסכמי מסחר והסכמים כלכליים עם גופים ואישים ישראלים. כמו כן הוחלט לאפשר חילופי