במכתב ההתפטרות שהגיש לשר כ"ץ כתב מרידור כי "במשך החודשים האחרונים וביתר שאת במהלך השבועות האחרונים היכולת לבצע את תפקידי הפכה לבלתי אפשרית. לצערי אתה (השר כ"ץ) לא מאפשר לי ולמשרתי ציבור רבים אחרים לעשות את עבודתנו".
בתגובה להודעתו מסר שר האוצר: "מרידור פעל באופן בוטה ופומבי נגד המדיניות שהובלתי, פרישתו היא מהלך נכון ומתבקש". גם נשיא המדינה ראובן (רובי) ריבלין התייחס באופן חריג למקרה ואמר: "הצעד הקשה בו נקט, והמשמעויות הנובעות ממנו, מדאיגות אותי מאוד".
התרעות פיקוד העורף