למרות כמה הישגים של המשרד להגנת הסביבה במסגרת חוק ההסדרים שאושר בממשלה, כולל השמירה על קרן הניקיון שלא תעבור לידי ש"ס, הרי שבנושא המשך העסקת יועצים סביבתיים - נחל המשרד הממשלתי הפסד כואב. מאמצי משרד האוצר להדיח את היועצים הסביבתיים ולאפשר העסקת ידיים חיצוניות נשאו פרי - וההצעה אושרה בממשלה. האוצר, כך מתברר, מתעקש להדיח ממוסדות התכנון את יועצי המשרד להגנת הסביבה, במטרה לזרז תכנון תשתיות ומפעלים, ולהחליפם ביועצים מטעם מהשוק הפרטי.
"זה מהלך קיצוני שיביא להחלשת השיקולים הסביבתיים בהליכי התכנון. היועצים הסביבתיים שלנו מתבססים על התשתית המקצועית והמדיניות הסביבתית הכוללת של המשרד באופן שמאפשר בחינה מעמיקה של ההשלכות הסביבתיות בכל תוכנית. הפרטת הייעוץ הסביבתי תפגע באיכות ההחלטות בהליכי התכנון באופן אקוטי, ולא נוכל להסכים למהלך הזה, שהוא בכייה לדורות", אומרים אנשי המקצוע במשרד להגנת הסביבה. למרות זאת, השרה עידית סילמן הצביעה בעד ההחלטה.
מאבק נוסף של המשרד להגנת הסביבה נסב סביב החוק הסביבתי החשוב שחוקקה הכנסת - חוק אוויר נקי. המשרד הצליח לצמצם הצעה מרחיקת לכת שהביא האוצר, שלפיה תתאפשר הפעלה חריגה של תחנות הכוח המזהמות ביותר, בניגוד להיתרי הפליטה שלהן.
"גובש מתווה מאוזן, שייתן מענה למצבים שבהם צפויה פגיעה באספקת החשמל, בכפוף למנגנוני אישור, בקרה ואכיפה", נמסר מהמשרד להגנת הסביבה, שהצליח לבלום לעת עתה גם את נטילת סמכויותיו בתחום אכיפת תקנות הרעש בהקמת תשתיות ומפעלים שהאוצר ביקש לקדם.