עם הידיעה על מותו, שיתפו פוליטיקאים ישראלים רבים בחוויותיהם עמו והשתתפו בצער המשפחה. ראש הממשלה בנימין נתניהו צייץ בטוויטר כי קיבל בצער רב את הבשורה על מותו של מקיין, וציין כי הוא היה "פטריוט אמריקני גדול וידיד אמת של ישראל". לדבריו, "תמיד אוקיר בלבי את הידידות האיתנה שלו כלפי עם ישראל וכלפיי באופן אישי. תמיכתו העקבית בישראל נבעה מאמונתו בערכי הדמוקרטיה והחופש. מדינת ישראל מצדיעה לג'ון מקיין".
שרת המשפטים איילת שקד: "ג'ון מקיין היה אחד מידידיה הגדולים של ישראל. גיבור אמריקאי, שסירב להשתחרר משוביו במלחמת ויטנאם טרם שחרורם של לוחמים אחרים. אהב את ארצו בכל מאודו והכיר את אתגריה של מדינת ישראל. לאורך 36 שנות שירותו הציבורי בבית הנבחרים ובסנאט, ממשלות ישראל ידעו תמיד שיש להן שם חבר. יהי זכרו ברוך".בצער רב קיבלתי את הבשורה על מותו של ג'ון מקיין, פטריוט אמריקני גדול וידיד אמת של ישראל. תמיד אוקיר בלבי את הידידות האיתנה שלו כלפי עם ישראל וכלפיי באופן אישי. תמיכתו העקבית בישראל נבעה מאמונתו בערכי הדמוקרטיה והחופש. מדינת ישראל מצדיעה לג'ון מקיין pic.twitter.com/VijCckW71n
— Benjamin Netanyahu (@netanyahu) August 26, 2018
שר הביטחון אביגדור ליברמן צייץ כי מקיין היה "מגדולי ידידינו, גיבור אמריקני שלחם בויאטנם ואף נפל בשבי". לדברי ליברמן, "באחד המפגשים האחרונים שלנו בוושינגטון, הראה לי תמונה מתקופתו בשבי ואמר: "למרות הסבל הנורא מעולם לא פקפקתי במחויבות שלי לערכים של חופש וצדק”. מקיין ייחסר לכולנו, מאוד. יהי זכרו ברוך".
אנו חולקים היום כבוד אחרון לסנטור ג׳ון מקיין ונפרדים מאדם ומנהיג בעל ערכים איתנים, מגן ולוחם למען עמו וידיד אמת של מדינת ישראל.
— ראובן (רובי) ריבלין (@ruvirivlin) August 26, 2018
אנו שולחים את תנחומינו הכנים מלב דואב על לכתו למשפחתו ולעם האמריקאי כולו. pic.twitter.com/wbcxAKq7mk
ראש ממשלת ישראל לשעבר, אהוד ברק, ספד למקיין ואף שיתף תמונה משותפת שלהם בטוויטר: "הלך לעולמו ג׳ון מקיין. גיבור אמריקאי. וככל שזה נדיר כיום, גם מנהיג פוליטי עם עקרונות. ידיד ענק של ישראל. בעיקר של בטחון ישראל - וחבר אישי יותר מ20 שנה. איש שהיה מרחק נגיעה מהבית הלבן ומעולם לא נפל ברוחו. לא בשבי בויאטנם ולא בשיאי הקריירה בוושינגטון או בסיוריו בעולם. יהי זכרו ברוך"
— אהוד ברק (@barak_ehud) August 26, 2018