בית המשפט קבע כי "מהרגע הראשון זכה הנאשם ליחס מנוכר מצד החוקרים. העבירות בהן הואשם הנאשם אמנם חמורות, אך נפגעה זכותו להליך הוגן". כזכור, במהלך מעצרו של הנאשם הפעילה המשטרה כלא מדומה כאשר מדובבים שוטרים שהיו בתא עם הנאשם הרעיבו את הנאשם, השפילו אותו, איימו עליו ברצח ובאונס עד שנשבר והודה במעשיהם שיוחסו לו.
בעקבות זיכוי הנאשמים נמסר מהשב"כ כי "במסגרת חקירתו בשב"כ ובמשטרת ישראל במהלך שנת 2015 הודה אחד הנאשמים במספר עבירות חמורות וקשות, תוך שהוא מוסר פרטים הקושרים אותו ואת חבריו להתארגנות ה"מרד" לביצוע העבירות, ומרחיב פרטים באשר למניע האידיאולוגי שמכוחו הם פעלו. במסגרת ההליך המשפטי בעניינם של הנאשמים, קבע בימ"ש המחוזי במחוז מרכז, בחודש ינואר 2019, שלא לקבל כראיה את הודאותיו האמורות של הנאשם, וזאת על אף שלא הייתה מחלוקת כי חלק ניכר מההודאות הרלוונטיות התקבלו במסגרת חקירות בהן לא הופעל כל אמצעי פסול".
עוד נמסר, כי "שב"כ מכבד את החלטת בית המשפט וימשיך לפעול בהתאם לחוק ולפסיקה במטרה לשמור על ביטחון המדינה ולסכל טרור באשר הוא טרור, ללא קשר לזהות מבצעיו. יודגש, כי שב"כ דוחה ניסיונות גורמים בעלי עניין שונים לעשות שימוש לא ראוי בהחלטת בית המשפט על מנת לנגח את שב"כ ולבצע דה-לגיטימציה לפעילות הארגון בכלל, ולפעילות היחידה לסיכול טרור וחתרנות בקרב יהודים וזרים בפרט".
התרעות פיקוד העורף